miércoles, 29 de febrero de 2012

unidad 3 Unidad 3 ORGANIZACIÓN DEL MATERIAL GENÉTICO


              INSTITUTO TECNOLÓGICO DE CIUDAD ALTAMIRANO
                          
Unidad 3 ORGANIZACIÓN DEL MATERIAL     GENÉTICO


Presenta
Nombre del Alumno
Luz  Eugenia Ruiz Najara
                                              Carrera Lic biología
                            
                   Ciudad Altamirano, Gro. 27México. Febrero del 2012
                                      
                                            
INTRODUCCIÓN
UNIDAD 3. ORGANIZACIÓN DEL MATERIAL GENÉTICO
            Este trabajo tiene la finalidad comprender   como está organizado  el materia genético   de los  organismos  procariontes   y también de los organismos eucarionticos  se debe tener en cuenta las carteristicas importantes presentan cada una  de los organismo   posteriormente se tomar en cuenta  Las proteínas asociadas que se presenta en las célula procariotas  en caso de las células eucariontes se toma en cuenta   como está estructurado el ADN  lineal  también debemos tener en cuenta proceso de empaquetamiento que se lleva acabo también  se debe saber  cuáles son los principales regiones comprender un  debido a que los  genes  contiene  segmento de dna llamada  intrones que se encuentra intercalados en la región  trascrita del gen  los intrones no    contiene  información  para la formación  
                     
OBJETIVO    GENERAL
CONOCER LA ORGANISACION  DEL  MATERIAL GENETICA  DE LOS ORGANISMOS  PROCARIONTA Y EUCARIONTA
OBJETIVOS ESPECÍFICO
Se  debe identificar   las proteínas  asociadas en los organismos procariontes
Conocer las estructura de los bacteriófagos
Conocer el número de pares de cromosomas  en diferentes especies  de    plantas y   animales
Metodología
Para realizar esta investigación sobre la organización  del material genético  se necesito  hacer una investigación  documental en  diferentes  libros  de biología molecular  se realizo un resumen de la información más importante  para después plasmar la información  suficiente
                                                             
UNIDAD 3. ORGANIZACIÓN DEL MATERIAL GENÉTICO
La organización  de los genomas  es importante  para comprender como se trasmiten  los genes. Para que los  genes sean  correctamente  trasmitidos durante la  división  celular, los genes  deben ser duplicados  y deben  segregar celular hijas
3.1 Organismos procarióticos
En general, los genomas bacterianos tienen un tamaño inferior a 5 Mb, aunque en el caso de Bacillus megaterium el genoma tiene un tamaño de 30 Mb
                                                       3.1.1 ADN circular
     El genoma de la mayoría de los procariontes esta formado por un único cromosoma.   Normalmente es una molécula de DNA de doble cadena cerrada   y circular
3.1.1 ADN CIRCULAR GENOMA PROCARIONTE
El genoma de la mayoría de los procariontes esta formado por un único cromosoma. Normalmente es una molécula de DNA de doble cadena cerrada y circular. Los genes bacterianos están muy agrupados, con distancias intergénicas muy pequeñas, y los intrones son muy escasos. En algunas regiones, varios genes están relacionados y se organizan en un grupo, y solo se forma una molécula de RNA de todo el grupo (a esta unidad se le llama operón.)


                                                        
3.1.2 Proteínas asociadas
El DNA en bacterias se  organiza en un nucleoide Que se forma por un superenrrollamiento
Superenrrollamiento puede  ser positivo   (p.earqueas   ) o negativo (eubacterias)
Superenrrollamiento puede ser positivo (p.e. arqueas) o negativo (eubacterias).
- Superenrrollamiento (-): la molécula torsionada gira hacia la derecha
- Superenrrollamiento (+): gira a la izquierda.
. El superenrrollamiento es una forma de liberar la tensión torsional producida por la adición (+) o sustracción (-) de vueltas en una molécula circular de DNA
                                                      
Arquitectura del genoma en procariotas

      En E.coli existen una serie de proteínas relacionadas con el empaquetamiento del DNA que reciben el nombre de proteínas similares a histonas p.e. histone-like nucleoide structuring protein (H-NS), integration host factor (IHF) etc.
Dichas proteínas tienen un bajo peso moleular y los genes que las codifican existen en múltiples copias, sin embargo su similitud con las histonas de los eucariotas es muy baja
El nucleoide de E. coli está constituido por un núcleo central proteico del que irradian 40-50 lazos de DNA superenrollado que contienen 100 Kb de DNA.
Estas proteinas posiblemente son capaces de remodelar el grado de compactación del DNA del nucleoide, influyendo sobre la expresión génica.
El nucleoide de E. coli está constituido por un núcleo central proteico del que irradian 40-50 lazos de DNA superen rollado que contienen 100 Kb de DNA


central proteico del que irradian 40-50 lazos de DNA superenrollado que contienen 100 Kb de DNA.
3.1.3 ADN extra cromosómico.
                Genomas plásmidos
Las células bacterianas contienen comúnmente pequeños elementos de DNA que no son esenciales para las operaciones básicas de la célula. Estos componentes se denominan plasmados. Los plásmidos no pueden vivir fuera de la célula. Los plasmidos bacterianos contienen a menudo genes que son útiles para la célula huésped, p.e. confieren resistencia a  antibióticos, promueven la fusión o producen toxinas. La mayor parte de ellos se encuentran en mitocondrias y cloroplastos
Resumen:
1. Moléculas extracromosómicas de DNA, circulares o lineales, que coexisten con el genoma de la bacteria.
2. Existencia autónoma del cromosoma bacteriano (raramente se insertan).
3. Portadores de genes no presentes en el cromosoma bacteriano p.e. genes de resistencia a antibióticos.
4. Un mismo plásmido puede hallarse en especies distintas de bacterias.
5. Por todo ello no suele considerárseles como parte del genoma bacteriano propiamente dicho, aunque en algunos casos ésto sea muy discutible


3.1.3.2 Bacteriófagos
Los fagos pueden generar el ciclo lítico o el ciclo lisogénico, aunque muy pocos son capaces de llevar a cabo ambos En el ciclo lítico, las células hospedadoras del fago son lisadas (destruidas) tras la replicación y encapsulación de las partículas virales, de forma que los nuevos virus quedan libres para llevar a cabo una nueva infección. en el ciclo lisogénico no se produce la lisis inmediata de la célula. El genoma del fago puede integrase en el ADN cromosómico de la bacteria hospedadora, replicándose a la vez que lo hace la bacteria En ocasiones, los profagos otorgan beneficios a la bacteria huésped mientras permanecen en estado letárgico al incorporarle nuevas funciones a su genoma; éste fenómeno se conoce como conversión lisogénica.
Acoplamiento
Para entrar en una célula, los fagos se acoplan a receptores específicos en la superficie de la bacteria, que pueden ser lipopolisacáridos, ácidos teicoicos, proteínas o incluso flagelos cada fago solo podrá infectar ciertas bacterias según sus receptores. Puesto que los fagos no son móviles
los bacteriófagos presentan una especie de jeringa mediante la cual introducen su material genético en el interior de la célula. Tras el reconocimiento del receptor adecuado, la cola y cuello del fago se contraen, quedando así el fago acoplado a la superficie celular.
Síntesis de proteínas y ácidos nucléicos
los ribosomas bacterianos comienzan a traducir el ARNm viral a proteínas. En el caso de los fagos basados en ARN, una RNA-replicasa es sintetizada al inicio del proceso.
Todo el sistema de traducción y de replicación normal de la bacteria se ve interrumpido y es forzado a producir nuevas partículas virales. Posteriormente, las proteínas helper  se encargarán de ensamblar las nuevas partículas virales.
 
Ensamblaje
 En el caso del fago T4, la construcción de nuevas partículas virales es un complejo proceso que requiere la ayuda de ciertas moléculas La cola y la cabeza o cápside del fago son construidas por separado y se ensamblan posteriormente de forma espontánea Después, el ADN es empaquetado en el interior de la cápside mediante un mecanismo no muy bien conocido aún. Todo el proceso puede durar unos 15 minutos.


Liberación de los fagos
Los fagos pueden ser liberados mediante lisis celular o por secreción celular. En el caso del fago T4, unos 20 minutos después de inyectar el material genético, más de 300 fagos son liberados vía lisis. La proteína que lleva a cabo la lisis es la endolisina, una enzima capaz de romper las moléculas de peptidoglicano de la pared bacteriana

Fago bacterian
                                        3.1.3.3 Transposones
La transposición es el fenómeno por el cual un elemento de DNA cambia de ubicación física en el cromosoma sin aprovechar ningún tipo de homología de secuencia, sino a través de una proteína específica denominada transposasa. Las características que distinguen la transposición de la recombinación son:
  • No requiere homología de DNA entre la secuencia dadora y la aceptora, aunque hay puntos calientes en regiones ricas en AT
  • Se produce una duplicación de la secuencia aceptora (entre 3 y 12 pb) antes y detrás del transposón
  • la intervención de la transposasa y, en algunos casos, la resolvasa.
  • La transposición puede reestructurar drásticamente la organización del cromosoma hospedador. Además, puede alterar la expresión de un gen, bien inactivándolo, bien sobreexpresándolo.
       Transposones procarióticos
    La clasificación se basa principalmente en los genes que aparecen
Tipo I
Se conocen como transposones simples o secuencias de inserción (IS) lo que en 700 o 2000 pb contienen el gen TnpA que codifica la transposasa flanqueado por dos secuencias invertidas repetidas cortas (15 a 25 pb).
Tipo II
Contienen al menos tres genes: una transposasa (TnpA), una resolvasa (TnpR) y un gen que suele ser de resistencia a antibióticos. Eso se encuentra flanqueado por secuencias repetidas invertidas (IR) a la izquierda (IR-L) y a la derecha (IR-R).
Tipo III
Aquellos fagos que, en lugar de insertarse en el genoma por recombinación —lo normal—, lo hace mediante transposición. El más conocido es el fago μ.

                           3.2 Organismos eucarióticos
Genomas nucleares eucarióticos
En los organismos eucarionticos, la mayoría de los genes se encuentra en los cromosomas del núcleo. Las especies eucarióticas se clasifican como diploides (dos series de cromosomas en el núcleo), o son haploides (1 sola serie de cromosomas en el nucleo) La letra n se utiliza para designar el número de cromosomas de un genoma nuclear de un organismo, la condición diploide es 2n y la haploide n. Las condiciones 3n, 4n, 5n, etc se conocen como poliploides.En una célula diploide, puesto que hay dos series cromosomitas, existen dos cromosomas de cada tipo. Los miembros de cada par se conocen como cromosomas homólogos  Los miembros de un par homologo básicamente son identicos y aportan los mismos genes, aunque muchas veces diferentes alelos (formas diferentes de un mismo gen).
3.2.1 ADN lineal y empaquetamiento
Estructura tridimensional de los cromosomas nucleares.
Una célula humana contiene alrededor de 2 metros de DNA (1 metro por cada serie cromosomica). El cuerpo humano está constituido por unas 1013 células y cada célula es diploide, por lo que contiene en total unos 2x1013 metros de DNA
3.2.1.1 Histonas
el empaquetamiento ocurre en el núcleo donde el DNA se condensa en 46 cromosomas, todo ello en un núcleo de 0,006 mm de diámetro! Para entender como ocurre esto hay que conocer la estructura tridimensional de los cromosomas La mezcla completa de materiales  de los que se compone el cromosoma se conoce como cromatina. Se trata de DNA y proteínas. Las histonas son proteínas asociadas al DNA en los nucleososmas. Los nucleososmas (10 nm) están formados por un octamero compuesto por dos unidades de cada una de las histonas (H2A, H2B, H3 Y H4)
3.2.1.2 Solenoides
El DNA (asociado a las histonas) da dos vueltas alrededor de cada octamero de los nucleosomas (ver figura), el nucleosoma es una forma distendida, de una forma muy enrollada denominado solenoide (30 nm) , el solenoide mantiene su forma mediante otra histona H1.
3.2.1.3 Cromosomas Enrollamientos de orden superior.
Los cromosomas se encuentran muy enrollados, si un solenoide tiene de diámetro 30 nm, un cromosoma condensado tiene 700 nm. Para esto el solenoide se enrolla sobre un esqueleto proteico compuesto de la enzima topoisomerasa II, que es capaz de pasar una cadena de DNA a través de otra.La figura muestra el número de exones observados en muestras de tres organismos eucarióticos, la levadura del pan (Sacharomyces cerevisiae), la mosca del vinagre (Drosophila melanogaster) y mamiferos.
                                     
                   Los genes están rodeados de mas DNA
Los análisis de secuencia han demostrado que hay DNA entre los genes, de función desconocida la mayor parte. El tamaño y la naturaleza de este DNA dependen del genoma. En hongos, este DNA intergénico es pequeño, pero en mamíferos es Desde un punto de vista conceptual, en algún lugar entre los propios genes y estas regiones intergénicas existen secuencias de DNA que pueden estar bastante alejadas de un gen pero que afectan su regulación. Pueden ser considerarse parte de la unidad funcional del gen, En muchas eucariotas, el DNA que esta entre los genes puede ser de tipo repetitivo, consistente en varios tipos de diferentes de unidades que se repiten a través del genoma. El DNA repetitivo

                 
también puede encontrase dentro de los intrones. La cantidad de DNA repetitivo varia entre diferentes especies e incluso existen variaciones del número de repeticiones dentro de una especie. La función del DNA repetitivo es todavía un misterio
         
Tamaño del genoma
os tamaños de os genomas se miden en unidades formadas por miles de bases de nucleótidos (llamados kilobases, kb) o millones de pares de nucleótidos (mega bases, mb),
3.2.3 ADN mitocondrial.
Los cromosomas de mitocondrias y cloroplastos son de DNA de doble cadena. Los cromosomas de los orgánulos contienen genes específicos de las funciones que lleva cabo el orgánulo, sin embargo la mayoría de funciones del organulo están codificadas en el núcleo. Las mitocondrias y cloroplastos probablemente se originaron por endosimbiosis de una procariota Las mitocondrias  se encuentran en todos los seres eucariotas aerobio
contienen las enzimas para la mayor parte de las reacciones oxidativas que generan energía para las funciones celulares. Estas enzimas incluyen a la piruvato-deshidrogenasa, a las involucradas en el transporte de electrones, en la fosforilación oxidativa, en el ciclo del Krebs, y en la oxidación de los acidos grasos.
Caracteristicas 
Se trata de un circular un  circular  de adn
Helicoidal
Con doble hebra
Supercodesado
El tamaño varia  enormente entre  distinto organismo
En los animales, el genoma mitocondrial generalmente es menor a 20 kb (kilobases); por ej. en el hombre el ADNmt tiene 16.569 bp (pares de bases). Por su parte, el ADNmt de una
levadura contiene cerca de 80.000 bp (80 kb), mientras que en las plantas varia entre 100 y 2.000 kb. La mayor diferencia entre animales, hongos y plantas es que en los animales el ADNmt codifica algoun producto en casi toda su extensión, mientras que en el genoma mitocondrial de hongos y plantas existen largas secuencias de DNA que no codifican productos

           
 3.3 Organización genómica viral.
Un virus es una particula no viva que solo puede reproducirse a si misma infectando una celula viva y modificando la maquinaria celular de la huésped para general una descendencia de particulas virales. Los virus estan formados por una cubierta proteica y un núcleo central que contiene su genoma.  
Los genomas virales son muy distintos entre si, muchos estan compuestos de ADN, que cuando estan empaquetados puede ser de cadena sencilla y cadena doble. Algunos virus como el HIV (retrovirus) contiene genomas de RNA, algunos de cadena sencila y otros de cadena doble.
Los virus pueden tener DNA duplex, DNA monocatenario, RNA monocatenario o RNA duplex. En algunas ocasiones, el genoma vírico dispone de la información biológica necesaria para que la maquinaria de la célula a la que parasita trabaje para él




ESTRUCTURA
El tamaño de los virus está comprendido entre 20 y 300 nm. Ya que la mayoría miden menos de 250 nm Los virus están compuestos de un núcleo central formado por ácido nucleico (DNA o RNA, pero nunca los dos en el mismo virión) rodeado por una proteína que constituye la cápsida
El núcleo central y la cápsida forman conjuntamente la nucleocápsida del virión. Además de las proteínas de la cápsida,
Las características usadas para la clasificación de los virus se basan en:
a.- Tipo de células hospedadoras (animal, vegetal, bacteriana)
b.- Naturaleza química del ácido nucleico (RNA, DNA)
c.- Morfología del virión (helicoidal, icosaédrico, complejo)
d.- Lugar de replicación (núcleo, citoplasma)

Resumen:
1. Los genomas víricos pueden ser de DNA o RNA y de cadena doble o sencilla.
2. Los genomas de RNA de doble cadena están segmentados (constituidos por distintas moléculas de RNA, cada una de ellas portadora de un determinado gen). Los genomas de RNA de cadena sencilla pueden estar segmentados.
3. Los genomas de DNA de doble cadena pueden ser lineales o circulares.
4. Genes solapados: una misma secuencia puede codificar distintas proteínas funcionales dependiendo del marco de lectura escogido.
5. Los retrovirus posee en un enzima denominado transcriptasa reversa capaz de sintetizar una copia de DNA a partir de una molécula de RNA
6. En ciertos casos, los virus sintetizan enormes poliproteinas que posteriormente son escindidas enzimáticamente para dar lugar a varias proteínas función
                                   BIBLIOGRAFÍA
1.-. Avers, Ch. 1987. Biología Celular.
2.- .Brown,C.M; I. Campbell y F.G. Priest 1989. Introducción a la Biotecnología.
3 - Clark. 1996. Plant Molecular Biology.
4.- De Robertos y Robertis, F. K. 1987. Biología celular y molecular.
5.- Gardner, E. J. 1979. Principios de genética.
6 - Glick y Pasternak. 1998..Molecular biotecnology.
7 - Griffiths et al. 1997. Genetica. McGraw-Hill/Interamericana. España.
8 - Griffiths et al. 1999. Genetica moderna. McGraw-Hill/Interamericana. España.
9.- . Karp, G. 1992. Biología celular
10.- . Levine, R. 1981. Genética. Compañía.



                                             




                                                               

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